miRNA在植物phyB介导的光信号通路中发挥怎样的作用？ | 新研究
光敏色素B（phyB），是水稻光敏色素家族的一员，在调控一系列发育过程和应激反应中发挥重要作用。然而，水稻中phyB介导的光信号通路涉及的机制却鲜有报道。MicroRNAs（miRNAs）在植物生长发育和应激反应中也发挥重要作用。因此，探索水稻中miRNAs在phyB介导光信号通路中的作用就变得很有趣。
山东省农业科学院谢先芝教授领衔的团队，综合采用高通量测序和降解组分析，鉴定了参与phyB介导光信号通路中的miRNAs及其靶基因。测序从四叶期野生型（WT）水稻和五叶期phyB突变体水稻中共鉴定出720个已知miRNA，704个新miRNA，以及1957个靶基因在野生。其中，135个miRNAs显示差异表达，表明这些miRNAs的表达受phyB直接或间接地控制。此外，鉴定出其中32个差异表达的miRNAs可以剪切70个水稻基因。分析这些靶基因显示，不同转录因子家族的成员所占比例最大，表明miRNA参与phyB介导的光信号通路很可能主要是通过调控转录因子的表达。
此项研究结果为表征miRNAs在phyB介导的光信号通路中的功能提供了新线索，有助于全面揭示植物中光敏色素介导的光形态发生和应激反应的分子机制。
本研究中小RNA测序和降解组测序分析项目由联川生物协助完成
测序数据分析使用联川生物专利的ACGT101-miR软件
参考文献
Wei Sun, Xiao Hui Xu, Xiu Wu, et al. (2015) Genome-wide identification of microRNAs and their targets in wild type and phyB mutant provides a key link between microRNAs and the phyB-mediated light signaling pathway in rice. Front. Plant Sci., 6(372).